เคปทาวน์ -ในเดือนธันวาคม 2020 แอฟริกาใต้ตรวจพบตัวแปร Beta และในเดือนพฤษภาคม 2021 ตรวจพบตัวแปร Delta เนื่องจากการเฝ้าระวังจีโนมที่มีประสิทธิภาพ ศาสตราจารย์ Tulio De Oliveira นักชีวสารสนเทศศาสตร์ที่มีชื่อเสียงซึ่งเป็นผู้ระบุตัวแปรเบต้า อธิบายถึงความสำคัญของการจัดลำดับจีโนม ศาสตราจารย์ De Oliveira เป็นผู้อำนวยการของ KwaZulu-Natal Research Innovation and Sequencing Platform (KRISP) และ Center for Epidemic Response and Innovation (CERI) ในแอฟริกาใต้
การจัดลำดับจีโนมมีความสำคัญต่อการตอบสนองของ COVID-19 อย่างไร?
การจัดลำดับจีโนมมีความสำคัญมากสำหรับการตอบสนองของ COVID-19 สายพันธุ์ใหม่ๆ ก่อตัวขึ้นตลอดเวลา ดังนั้นข้อมูลจีโนมจึงเป็นแนวทางให้ประเทศต่างๆ ทำการตัดสินใจด้านสาธารณสุขอย่างรวดเร็วและมีข้อมูลครบถ้วนตั้งแต่เริ่มเกิดโรคระบาด ตัวอย่างเช่น เราแจ้งกระทรวงสาธารณสุขและประธานาธิบดีซีริล รามาโฟซาทันทีเมื่อเราพบตัวแปรเบต้าในแอฟริกาใต้ในช่วงต้นของคลื่นลูกที่สองของเรา ภายในหนึ่งวัน มีการร่างกฎหมายใหม่เพื่อให้ประเทศสามารถล็อกดาวน์ในระดับที่สูงขึ้นเพื่อควบคุมการติดเชื้อและช่วยชีวิตผู้คน ใช้เวลาน้อยกว่า 48 ชั่วโมงในการรู้เกี่ยวกับตัวแปรใหม่ในการทำเช่นนั้น และมันก็เหมือนกันกับตัวแปรเดลต้าในคลื่นลูกที่สามคุณค่าของการจัดลำดับจีโนมสำหรับการตอบสนองด้านสาธารณสุขมีมากกว่าแค่การรู้ว่าเมื่อใดควรเข้าสู่ภาวะล็อกดาวน์ สามารถช่วยให้แต่ละมณฑลเตรียมพร้อมสำหรับไฟกระชากที่อาจเกิดขึ้นและดำเนินการตามขั้นตอนที่สำคัญ เช่น การเพิ่มปริมาณออกซิเจน เปิดเตียงในโรงพยาบาลมากขึ้น หรือเพิ่มการทดสอบ เนื่องจากสิ่งเหล่านี้เป็นตัวแปรที่สามารถแพร่เชื้อได้มากกว่า การช่วยให้ประเทศต่างๆ เลือกวัคซีนที่เหมาะสมที่สุดเพื่อใช้ในบริบทของแอฟริกาก็มีความสำคัญเช่นกัน ความลังเลใจในการฉีดวัคซีนเป็นปัญหาใหญ่ ดังนั้นเราต้องทำให้ถูกต้องในครั้งแรกและตรวจสอบให้แน่ใจว่าวัคซีนที่เปิดตัวเป็นตัวเลือกที่มีประสิทธิภาพมากที่สุด พื้นฐานข้อมูลจีโนมของการตัดสินใจของแอฟริกาใต้ในการใช้วัคซีนของ Johnson & Johnson และ Pfizer COVID-19
นอกจากนี้ยังมีขั้นตอนที่ประเทศต่างๆ สามารถทำได้เพื่อตอบสนอง
ต่อพันธุ์ใหม่ๆ โดยไม่ต้องมีข้อมูลจีโนม แองโกลาเป็นตัวอย่างที่ดีในการใช้มาตรการรับมือด้านสาธารณสุขอย่างง่ายเพื่อป้องกันไม่ให้สายพันธุ์ต่างๆ เข้ามาในประเทศ ด้วยการทดสอบจุดเข้าประเทศของผู้เดินทางทุกคน ประเทศนี้สามารถแยกผู้ป่วยที่เป็นบวกส่วนใหญ่และชะลอการแพร่กระจายของสายพันธุ์ที่น่ากังวลที่อันตรายกว่าเหล่านี้ได้โดยไม่ต้องสั่งห้ามการเดินทาง การห้ามเดินทางมีค่าใช้จ่ายสูงในเชิงเศรษฐกิจ แต่ระบบคัดแยกและการทดสอบที่ดีที่จุดเข้าก็มีประสิทธิภาพพอๆ กัน ฉันคิดว่าโลกสามารถเรียนรู้ได้มากมายจากกลยุทธ์นี้และจาก Dr. Silvia Lutucuta รัฐมนตรีว่าการกระทรวงสาธารณสุข และ Dr. Joana Moraes อธิบดีกรมอนามัยในแองโกลา
มีความก้าวหน้าอะไรบ้างในการจัดลำดับจีโนมในแอฟริกา
การเฝ้าระวังจีโนมกำลังก้าวหน้าอย่างรวดเร็วในแอฟริกาและเติบโตอย่างมากในปีนี้ ทวีปนี้ใกล้จะจัดลำดับจีโนมได้มากถึง 50,000 จีโนมแล้ว เมื่อต้นปี เรามีจีโนมไม่ถึง 10,000 จีโนมด้วยซ้ำ การเพิ่มขึ้น 5 เท่านี้เป็นผลมาจากการลงทุนจำนวนมากและการเสริมสร้างศักยภาพตั้งแต่เริ่มเกิดโรคระบาด มีเรื่องราวความสำเร็จมากมายของประเทศที่ก่อตั้งมาอย่างดี เช่น แอฟริกาใต้ แองโกลา ไนจีเรีย และเคนยา และประเทศที่ตามทันอย่างรวดเร็ว เช่น บอตสวานา
ที่ KRISP & CERI เราเชื่อจริงๆ ว่าสิ่งสำคัญคือการขยายการจัดลำดับจีโนมในภูมิภาคด้วยวิธีการแบบองค์รวมและยั่งยืนโดยทำงานร่วมกับพันธมิตร เช่น WHO และศูนย์ควบคุมและป้องกันโรคแห่งแอฟริกา (Africa CDC) KRISP และ CERI ทำการจัดลำดับจีโนมสำหรับประเทศในแอฟริกาหลายแห่ง แต่เรายังแบ่งปันโปรโตคอลทั้งหมดของเรากับประเทศต่าง ๆ ตลอดจนเสนอให้ฝึกอบรมช่างเทคนิคเพื่อเพิ่มขีดความสามารถ
เมื่อเร็วๆ นี้ มาลาวีได้ส่งช่างเทคนิคสองคนมาที่โรงงานของเราเพื่อเรียนรู้ และภายในหนึ่งสัปดาห์หลังจากพวกเขากลับมา ประเทศก็เริ่มผลิตข้อมูลของตนเองแล้ว อีกตัวอย่างหนึ่งคือยูกันดาซึ่งจัดลำดับจำนวนมากด้วย Oxford Nanopore Technologies แต่ประเทศนี้เพิ่งส่งนักวิทยาศาสตร์อาวุโสสองคนมาที่ห้องทดลองของเราเพื่อเรียนรู้เกี่ยวกับการจัดลำดับอิลลูมินา ขณะนี้มีสองแพลตฟอร์มที่แตกต่างกันที่จัดตั้งขึ้นในประเทศ
Credit : วิธีซ่อมแก้ไข รถยนต์ รถมอเตอร์ไซ | นักบาส NBA | รีวิวรองเท้า | แคมป์ปิ้ง
